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重大升级:BIONUMERICS 8.0正式发布



BioNumerics软件作为唯一一个能整合所有分子分型数据分析功能于一体的综合性数据分析平台,随着分子分型技术的发展,其数据分析功能也逐步增加与升级。近期,Applied Maths公司隆重推出了最新BIONUMERICS 8.0版本,新版本软件无论从软件界面、语言、软件配置、数据分析功能等方面均进行了重大升级。

1. 中文版软件界面(http://www.shanghaiep.com/)
第一个惠及我们中国用户的改进是8.0版本增加了中文语言包,软件界面和图标形式也进行了重新设计和优化。

2. 软件配置(http://www.shanghaiep.com/)
新版软件简化了软件的模块配置形式,根据所分析应用的不同,软件主要包括BIONUMERICS-GEL、BIONUMERICS-SEQ、BIONUMERICS-MALDI和
BIONUMERICS-SUITE四种配置,分别用于凝胶图谱分析、序列分析、微生物质谱数据分析以及包含以上所有的功能分析。用户可以根据自己的实际应用需求,方便选择适合的软件配置。

3. 本地Calculation engine
除过上述软件界面及配置的更新,相信大家更关注的是软件功能的升级。新版本软件对全基因组数据分析方式进行了重大升级,类似于云端数据分析流程,将分析内容以任务形式提交,用户可在本地计算机进行de novo assembly,reference mapping,wgMLST分析,wgSNP分析以及RAxML和FastTree发育树的构建,方便对全基因组数据进行更全面的挖掘与探索。

4. 云端Calculation engine
云端数据分析新增更多分析功能,增加三代测序数据分析功能,可以将二代测序的准确性和三代测序读长长的特性结合起来,获得更完整、更准确的全基因组序列。云端分析增加更多拼接算法,包括Velvet,SPAdes,SKESA,Unicycler等,将基因组注释,SNP分析,RAxML和FastTree发育树构建等复杂的运算分析以任务形式提交至云端 Calculation engine进行,不需要耗费本地计算机资源,也无需复杂的设置,即可轻松从云端获取最终分析结果。

5. 全基因组分型插件
利用全基因组分型插件可以基于全基因组序列预测耐药基因,毒力因子,血清型等信息,新版本软件包含
Escherichia coli, Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), Listeria, Salmonella, Staphylococcus aureus等微生物的全基因组分型插件,可轻松实现从全基因组序列中一键式提取感兴趣基因序列,获得耐药,毒力等信息。


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2020年7月

 
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